Имеется трансформатор от микроволновки, говорят у него на выходе примерно. 3000Вольт можно ли подключить его наоборот? И стнанет ли он "пониижающим"

Станет, но там скорее доповышает умножитель напряжения

Да там на вторичке 3000 вольт. Первичка намотана толстым проводом, вторичка тонким. Чаще всего материал обмоток алюминий.
Если включить наоборот, то будет где-то 16 вольт, но ток слабенький, свои 1000 ватт он не выдаст.
Единственное путное применение это сделать точечную сварку. Вторичка аккуратно срезается, за место неё шинкой мотается несколько витков которые подключаются к электродам.
На холостом ходу трансформаторы от микроволновок греются, годятся только для кратковременного режима работы и желателен обдув (как и предусмотрено в печке)