Работаю на предприятии где постоянно происходит строительство новых пристроек, реконструкция старых помещений и из-за того, что проекты реконструкции чаще всего делают разные проектные конторы, то уже куча 1 ЩС-ов, 1 ЩО и т.д. выкручиваюсь подписывая 1 ЩС (подсобки), 1 ЩС (РЕСТОРАН) ...Так все таки как правильно поступить? Имею ли я сам право, как ответственный за Э/Х ввети свою нумерацию, что для этого требуется кроме внесения изменений в проект?

конечно используйте свою нумерацию, проект здесь не причем

Считаю это неправильным, так как я могу в отпуск, заболеть, уволиться и как после меня человек будет разбираться без проекта?

Лучше всего, еще на стадии проектирования решать этот вопрос с проектировщиками. Просить их не применять некоторые названия из прилагаемого списка. А по существующим щитам - конечно нужно изменять названия, внося изменения в (уже теперь) рабочую документацию

для этого существуют однолинейные и прочие схемы, которые обновляется в сроки указанные ПТЭЭП или по Вашей инициативе