Какими проводниками можно заземлять нейтраль силового трансформатора с глухозаземлённой нейтралью 6/0,4, только шинами, или можно гибким медным проводниками, или медным изолированным?

Металлической стальной полосой, сваркой внахлест к контуру заземления.

К вышесказанному добавлю, что в проектах видел заземление при помощи провода МГ.

4.2.25. Ошиновку РУ и ПС, как правило, следует выполнять из алюминиевых и сталеалюминевых проводов, полос, труб и шин из профилей алюминия и алюминиевых сплавов электротехнического назначения

Какое это имеет отношение к заземляющему проводнику?

Да бог его знает...)))

от РЕ шины медным изолированным по подстанции около стены переход на стальную шину заземления

--------------------------------------------------
Что-то вопроса не понял...
"...нейтраль силового трансформатора..." - это как?
Нулевой провод сети? Тогда причем здесь заземление и централь?
Заземление и нулевая фаза (централь при трехфазнике) - это совсем разные вещи.
Их соединять вообще нельзя...
А если где-то будет обрыв нулевого провода, тогда что будет?
Под фазу все встанет?

Вывод n вторичной обмотки...

ПУЭ, "1.7.100. В электроустановках с глухозаземленной нейтралью нейтраль генератора или трансформатора трехфазного переменного тока, средняя точка источника постоянного тока, один из выводов источника однофазного тока должны быть присоединены к заземлителю при помощи заземляющего проводника.
Искусственный заземлитель, предназначенный для заземления нейтрали, как правило, должен быть расположен вблизи генератора или трансформатора. Для внутрицеховых подстанций допускается располагать заземлитель около стены здания." Исходя из вышеуказанного, и, как уже указывалось: "Металлической стальной полосой, сваркой внахлест к контуру заземления". От себя добавлю, что полоса и сварка "внахлёст" проще в монтаже и удобнее в эксплуатации - отсутствие лишних болтовх соединений (контактов), которые требуют повышенного (по сравнению со сваркой) контроля и обслуживания.

но не следует забывать про измерение сопротивления заземляющего контура и проверку грозозащиты когда необходимо отсоединение от общей цепи.

Что Вы имели ввиду? Отсоединение ЗУ от нейтрали трансформатора? Так это легко выполнить на трансформаторе.

С комментарием №10 согласен полностью.
Особенно с выражением "...отсутствие лишних болтовх соединений..."
И всеми руками голосую "ЗА"...
Но с трансформаторами потребителей картинка получается несколько иная.
Корпуса нагрузок лучше всего иметь взвешенными от общей нейтрали и должны
обеспечиваться собственным контуром заземления.
А вот по поводу того, что контур заземления должен выполнять дополнительную
функцию молниеотвода - это весьма проблематичное высказывание (коммент №11).

чот я ничего не понял, попроще скажите

Проект не значит правильно!!!
ГОСТ..., всему голова!!!